피터를 구하기 위한 메리의 모험이 시작된다! 270여 장면의 영화 스틸컷으로 이루어진 애니메이션 그림책 『메리와 마녀의 꽃』. 가족들과 떨어져 혼자 이모할머니 댁으로 오게 된 메리. 따분한 하루하루를 보내던 메리는 어느 날, 길 잃은 고양이를 따라 숲으로 들어갔다가 신비한 꽃을 발견한다. 그 숲에만 존재하고 7년에 한 번밖에 피지 않는 비밀스러운 마녀의 꽃 ‘야간비행’. 야간비행과 낡은 빗자루를 매개로 마법 세계로 들어선 메리는 그곳에서 예상치 못한 마법 능력을 선보이며 주목받는다. 그러나 다시 집으로 돌아오기 위해 얼떨결에 거짓말을 하고 마는데…….